U Bosni i Hercegovini sve postaje problem pa i obični bosanski konj. Naime iako je autohtona bosanska pasmina, brdskog konja zaštitili su kao svoju autohtonu vrstu Slovenci.
Čovjek koji se bori da bosanski brdski konj bude zaštićena autohtona vrsta BiH stalno nailazi na podmetanja i nebrigu svih razina vlasti. Iako je uputio apel prema svim razinama vlastio o tome kako Slovenci po svaku cijenu žele zaštiti bosanskog brdskog konja kao svoju /slovensku/ pasminu nitko mu nije odgovorio niti bilo što poduzeo da se ta zlouporaba spriječi.
Problem je i u tome što BiH nema ministarstvo poljoprivrede na razini države nego samo na razini kantona.Jedino je reagiralo Udruženje bosanskog brdskog konja ali to je bilo sve.
Enver Žiga stručnjak koji je napisao čak 80 naučnih radova o bosanskom brdskom konju tvrdi da je ova vrsta već na dobroj cijeni. Da u FBiH ima čak devet ergela i stalno se povećava broj konja kako u zemlji tako i inozemstvu. Zanimljivo da u Republici Srpskoj nema ni jedne ergele bosanskog brdskog konja.
